La nourriture, réduite en bouillie par les contractions et les sucs de l'estomac, subit l'action des enzymes digestives qui dissocient les différents composés nutritifs. Les replis, villosités et microvillosités facilitent alors leur passage dans le sang en augmentant la surface de l'intestin grêle.
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C'est lors du passage dans l'intestin grêle que la majeure partie des aliments est absorbée par l'organisme.